依政府採購法第85條之1第3項準用民事訴訟法第77條之20第2項「調解不成立後三十日內起訴者，當事人應繳之裁判費，得以其所繳調解之聲請費扣抵之。」、第423條第1項前段規定「調解不成立後起訴者，其調解程序之費用，應作為訴訟費用之一部」，聲請人所繳納調解程序費用應作為訴訟費用之一部，得以扣抵訴訟裁判費，此不啻大大減輕了廠商請求救濟之負擔。然而如果已經繳裁判費了才發現此事，又該怎麼辦？按民事訴訟法第77條之26第1項規定「訴訟費用如有溢收情事者，法院應依聲請並得依職權以裁定返還之。」、同條第2項規定「前項聲請，至遲應於裁判確定或事件終結後三個月內為之。」。所以，應儘早具狀向法院聲請裁定返還溢繳之裁判費，以確保權益。

公共工程履約期間較長，過程發生爭議者，廠商通常為顧全大局，不會立即以具對立性之訴訟手段爭取權利，且政府採購法第85條之1第1、2項所設規定：「機關與廠商因履約爭議未能達成協議者，得以下列方式之一處理：一、向採購申訴審議委員會申請調解。二、向仲裁機構提付仲裁。前項調解屬廠商申請者，機關不得拒絕。工程及技術服務採購之調解，採購申訴審議委員會應提出調解建議或調解方案；其因機關不同意致調解不成立者，廠商提付仲裁，機關不得拒絕。」，對於廠商較為有利，因此，向管轄之行政機關採購申訴審議委員會申請履約爭議調解，係較為常見之作法。

農業局本身也是動保法的地方主管機關，如果廠商在執行職務上有虐待動物的情形，本來就可以依照動保法規定處理，如動保法第6條規定：「任何人不得騷擾、虐待或傷害動物。」或是第14-1條第1項規定：「捕捉動物，不得使用下列方法：一、爆裂物。二、毒物。三、電氣。四、腐蝕性物質。五、麻醉槍以外之其他種類槍械。六、獸鋏。七、其他經主管機關公告禁止之方法。」

現行的司法實務見解下，廠商走完調解程序後，可以不用再擔心之前的調解費用變沉沒成本，就算調解方案不盡人意，之後另向法院起訴時，還是可以向法院聲請退還溢繳費用

數位身分證政策被政府喊卡後，中央印製廠與廠商賠償金額兜不攏，協調四次仍破局，已經滿足前述「履約爭議未能達成協議」的前提要件，廠商依法向工程會採購申訴審議委員會申請調解，請求中央印製廠賠償損失，程序上可說理所當然。

，開始施作工程的過程中，甲機關因認為原始設計之工法有窒礙難行的疑慮，因此指示（建議）乙廠商變更施作工法，乙廠商則以新實施工法之價金、工期、施工內容等已逾原合約範圍，在廠商尚未承諾前，並沒有履行義務而拒絕施作，甲機關因此通知解除契約

何謂行政處分「附附款」？白話來說，就是機關對人民所做成的行政處分，附加上了一定的條件或負擔，並要求受處分人須至特定期限、履行某負擔或客觀事實達成某條件後，行政處分始發生規制效力。按行政程序法第93條規定：「行政機關作成行政處分有裁量權時，得為附款。無裁量權者，以法律有明文規定或為確保行政處分法定要件之履行而以該要件為附款內容者為限，始得為之。前項所稱之附款如下︰一、期限。二、條件。三、負擔。四、保留行政處分之廢止權。五、保留負擔之事後附加或變更。」