政府採購契約之成立，除應受一般民事法律規範外，尚須受政府採購法（以下僅列條號者，均同）相關法規之規範。其立法宗旨，係為建立政府採購制度，依公平、公開之採購程序，提升採購效率與功能，確保採購品質。因此，機關辦理採購，應以維護公共利益及公平合理為原則，對廠商不得為無正當理由之差別待遇（政府採購法第1條、第6條第1項規定參照）。

日前立法院與衛福部疾管署就該案的討論，疾管署主張：「……依據政府採購法第61條、政府採購法施行細則第84條規定，在特殊情況下，若決標內容涉及『商業機密』之機密採購，機關得不將決標內容納入決標結果之公告及對各投標廠商之書面通知。因此，疾管署辦理各項防疫物資（如新冠疫苗、猴痘疫苗、瑞德西韋、莫納皮拉韋）等之採購，涉及商業保密條款者，均依前述規定辦理……」，也就是主張依照施行細則第84條對於前述母法第61條的解釋，應該可以適用所謂的「特殊情形」，不將涉及商業機密的決標結果納入決標公告。

依照政府採購法第101條第1項第15款規定：「機關辦理採購，發現廠商有下列情形之一，應將其事實、理由及依第一百零三條第一項所定期間通知廠商，並附記如未提出異議者，將刊登政府採購公報：十五、對採購有關人員行求、期約或交付不正利益者。」，若判決有期徒刑以上之罪者，廠商將會被依照採購法第103條第1項第1款停權三年，然採購法為了嚇阻此種不廉潔的貪腐行為，要求機關還要向廠商追繳兩倍的不正利益。

在政府採購法第72條可是有前提要件的，原本採購案如果經驗收與契約、圖說、貨樣規定不符者，應通知廠商限期改善、拆除、重作、退貨或換貨，原則上沒有驗收不合格，還能「使用」的可能，除非是「驗收結果不符部分非屬重要，而其他部分能先行使用，並經機關檢討認為確有先行使用之必要者，得經機關首長或其授權人員核准，就其他部分辦理驗收並支付部分價金」，也就是驗收不合格的非屬重要的部分，其餘部分則可以「部份驗收」，來「先行使用」。無論如何要有一個驗收的程序，然後就驗收合格的部分，才能夠先行使用。

農業局本身也是動保法的地方主管機關，如果廠商在執行職務上有虐待動物的情形，本來就可以依照動保法規定處理，如動保法第6條規定：「任何人不得騷擾、虐待或傷害動物。」或是第14-1條第1項規定：「捕捉動物，不得使用下列方法：一、爆裂物。二、毒物。三、電氣。四、腐蝕性物質。五、麻醉槍以外之其他種類槍械。六、獸鋏。七、其他經主管機關公告禁止之方法。」

在這種由機關單方擬具契約條款為締約之情況，與民法上定型化契約頗為類似，那麼政府採購契約究竟是否為民法上的定型化契約，而有定型化契約效力的適用呢？

分包是合法的，轉包是違法的，文字上雖然看得出來，但個案上卻不好分辨，特別是什麼是契約的「主要部分」

政府採購法第25條規定，機關得視個別採購之特性允許廠商共同投標。所謂共同投標，是指二家以上之廠商共同具名投標，並於得標後共同具名簽約，連帶負履行採購契約之責，以承攬工程或提供財物、勞務之行為，另有工程會訂有《共同投標辦法》可參。

政府採購實務，關於「履約保證金」，係指為確保承攬人能依工程契約約定履行，於簽約時或簽約後一定期間內，廠商繳交一定金額予機關，作為履行工程契約之擔保。事實上，所謂履約保證金是「訂約」時即應給付，而非於「違約」發生損害時始得請求，此為履約保證的重點。